Podlaska Fundacja Rozwoju Regionalnego od 2005 roku posiada Certyfikat Systemu Zarządzania Jakością.

22 listopada 2010 r. został zatwierdzony System Zarządzania Jakością według normy ISO 9001:2008.

Certyfikat obejmuje również spółki zależne PFRR:

• Podlaski Fundusz Poręczeniowy Sp. z o.o.
• Podlaski Fundusz Kapitałowy Sp. z o.o.
• RCS Sp. z o.o.

Polityka Zintegrowanego Systemu Zarządzania

"Misją Podlaskiej Fundacji Rozwoju Regionalnego jest świadczenie usług na najwyższym poziomie na rzecz wszystkich klientów, a w szczególności partnerskie wspieranie rozwoju małych i średnich przedsiębiorstw oraz podejmowanie inicjatyw rozwoju województwa podlaskiego.

Rozwojowi działalności i usług towarzyszy dążenie do zapewnienia wysokich standardów bezpieczeństwa i higieny pracy oraz dążenie do zminimalizowania negatywnego oddziaływania na środowisko.(...)"